在含盐量为35000mg/L的海水反渗透系统中，结垢问题没有苦咸水中那样突出，海水受浓水渗透压所困，其系统回收率在30-45%之间，但为安全起见，当运行回收率高于35%时，推荐使用阻垢剂。
阳离子聚电介质可能会与负电性的阻垢剂发生协同沉淀反应并污染膜表面，必须保证当添加阴离子阻垢剂时，水中不存在明显的阳离子聚合物。
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